Hari Guru Nasional diperingati setiap tahunnya pada tanggal 25 November untuk menghormati jasa-jasa guru dan mengenang berdirinya Persatuan Guru Republik Indonesia (PGRI) pada tahun 1945. Pada tahun 2023, tema yang diangkat untuk peringatan Hari Guru Nasional adalah “Bergerak Bersama Rayakan Merdeka Belajar”. Tema ini mengajak seluruh insan pendidikan untuk bergerak bersama dalam merayakan kemerdekaan belajar dan meningkatkan kualitas pendidikan di Indonesia.
Spesialnya dalam peringatan Hari Guru Nasional ini pelaksanaan Upacara SMA N 3 Bantul bersama Wakil Kepala Dinas Pendidikan pemuda dan olahraga Drs. Suhirman, M. Pd ''Pembina Upacara'', melibatkan para Guru menjadi Petugas Upacara dan para Peserta Upacara siswa siswi SMA N 3 Bantul.
Persiapan upacara ini yakni pelatihan dari awal sampai H-1 pelaksanaan upacara. Jelang 25 November 2023, Sekolah tengah mempersiapkan moment spesial Hari Guru Nasional yang diawali dengan upacara bendera di pagi hari .Pelaksanaannya berbeda dengan upacara pengibaran bendera hari Senin , karena terdapat beberapa rangkaian acara yang harus dikerjakan pada saat upacara berlangsung, seperti amanat, pemberian penghargaan apresiasi kepada guru, pelantikan peserta didik dan lain lain.